Die Europäische Donau-Akademie entwickelt und koordiniert Projekte und Studienangebote in Zusammenarbeit mit wissenschaftlichen, kulturellen, politischen und zivilgesellschaftlichen Institutionen in den Donauländern, organisiert Konferenzen und gibt fach- und themenbezogene Publikationen heraus.  Mit ihrem Netzwerk und ihren Projekten trägt die EDA zur Völkerverständigung mit den südosteuropäischen Ländern bei und fördert damit den europäischen Integrationsprozess im Donauraum.